學(xué)校前身是1946年10月創(chuàng)建于蘭州的'國立獸醫(yī)學(xué)院。1950年，改名為西北獸醫(yī)學(xué)院；1951年，改名為西北畜牧獸醫(yī)學(xué)院；1958年，與籌建中的甘肅農(nóng)學(xué)院合并成立甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)。2012年6月，甘肅省人民政府和農(nóng)業(yè)部簽署協(xié)議共建甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)。學(xué)校從1953年開始招收研究生，是全國首批學(xué)士、碩士學(xué)位授予單位，第二批博士學(xué)位授予單位。
截至2020年12月，學(xué)校占地165萬平方米，建筑面積66萬平方米；設(shè)有23個學(xué)院（教學(xué)部），64個本科專業(yè)；擁有4個博士后科研流動站，8個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，1個交叉學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，1個專業(yè)博士學(xué)位授權(quán)類別，18個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，9個專業(yè)學(xué)位授權(quán)類別；有教職工1480人，專任教師1226人，其中高級職稱人員589人；有普通本科在校生17078人，碩士研究生2528人，博士研究生480人。